Post-Doctorant H-F : développement d'antibiogramme rapide

Chercheur Post-Doctorant H-F : développement d'antibiogramme rapide

Informations Générales :

Date de prise de fonction : Janvier 2025
Durée : CDD 12 mois
Renouvelable : ☐ OUI ☒ NON
Temps plein
Nombre d’heures hebdomadaires : 38,30 heures
Congés Annuels et RTT : 45 jours
Activités télétravaillables : ☐ OUI ☒ NON
Rémunération : 2909 € brut mensuel en fonction de l’expérience professionnelle sur des postes de niveau équivalent.

Structure d’accueil :

Structure UMR Inserm 1092 – RESINFIT
A propos de la Structure : RESINFIT existe depuis 2012. La thématique de recherche est la résistance aux anti-microbiens, antibiotiques et antiviraux avec un dimension One Health.
Directeur/ Directrice Marie-Cécile PLOY
Adresse : Centre de Biologie et de Recherche en Santé – François Denis 3ème étage Rue du Professeur Bernard Descottes – 87025 LIMOGES

Description du poste

Mission principale

Un des éléments clés pour la lutte contre l’antibiorésistance est le développement de nouvelles méthodes d’antibiogramme rapide.

L’objectif du projet est de développer un antibiogramme rapide basé sur la technologie de fractionnement par couplage flux-force de sédimentation (SdFFF) avec un rendu de résultat en moins de 3 heures. Des antibiogrammes conventionnels issus de la méthode de référence (microdilution en milieu liquide) seront comparés aux antibiogrammes rapides obtenus par la méthode SdFFF.

Une Emploi type Institut national de la santé et de la recherche médicale 2 centaine de souches de différentes espèces de bacilles à Gram négatif (Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa) seront testées. Un panel de plusieurs antibiotiques à usage humain et/ou vétérinaire sera testé.

La technologie sera également appliquée directement à partir de flacons d’hémocultures positifs à bacilles à Gram négatif provenant de patients hospitalisés au CHU de Limoges. Les performances de la technologie SdFFF seront déterminées pour chaque couple espèce bactérienne/antibiotique selon la norme NF EN ISO 20776.

Activités principales

Mettre en culture des souches bactérienne en variant les conditions de culture : inoculum bactérien, milieu de culture, vitesse d’agitation, oxygénation.
Etablir des protocoles d’analyses standardisés en SdFFF : réduction du temps d’analyse et optimisation des conditions d’élution.
Caractériser les profils de résistance des bactéries : réalisation des expériences et interprétation des résultats.
Confronter les résultats des antibiogrammes rapides obtenus par SdFFF aux résultats des antibiogrammes obtenus par les méthodes conventionnelles : déterminer les données de concordance, de discordances majeures et de discordances mineures.
Mettre au point un protocole expérimental d’antibiogrammes rapides obtenus par SdFFF directement à partir de flacons d’hémoculture.
Déterminer des différents paramètres (sensibilité, linéarité, répétabilité, reproductibilité, robustesse / conditions culturales et d’incubation avec les antibiotiques) dans le cadre d’un plan d’Assurance Qualité, nécessaire pour le marquage CE.
Présenter ses résultats lors des réunions de laboratoire et participation à la vie du laboratoire (tâches communes).
Rédiger des articles scientifiques et des rapports
Présenter les travaux lors de congrès.

Connaissances

Le candidat doit avoir des connaissances dans le domaine de la microbiologie et plus particulièrement dans le domaine des antibiotiques et des mécanismes de résistances aux antibiotiques. Le candidat doit aussi avoir des connaissances sur le développement de méthodes analytiques.

Savoir-faire

Culture bactérienne, réalisation d’antibiogrammes par méthode de référence, réalisation d’antibiogrammes par SdFFF, élaboration de protocoles expérimentaux, comparaison de méthodes analytiques, analyses statistiques.

Aptitudes

Autonomie et esprit d’initiative ; qualités organisationnelles et intégration dans un collectif ; bon niveau d’anglais et de rédaction ; intérêt pour l’encadrement d’étudiants. Le désir de travailler dans le domaine de la recherche translationnelle au sein d’une équipe pluridisciplinaire est un prérequis.

Expérience(s) souhaité(s)

Une première expérience post-doctorale est souhaitée

Niveau de diplôme et formation(s)

Doctorat en Sciences

Pour en savoir plus

Sur l’Inserm : https://www.inserm.fr/ ; site RH : https://rh.inserm.fr/Pages/default.aspx
Sur la politique handicap de l’Inserm et sur la mise en place d’aménagements de poste de travail, contactez la Mission Handicap : emploi.handicap@inserm.fr

Contact :

Date limite de candidature : 7/11/24
Envoyer CV et lettre de motivation à : cindy.demay@inserm.fr
Laboratoire : UMR Inserm 1092 (RESINFIT)
Adresse complète : CBRS, rue du Pr Bernard Descottes, 87025 Limoges Cedex.

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