Stage Master 2 – Biocalcification chez des bactéries marines : caractérisation des mécanismes enzymatiques

Contexte :

Dans le cadre du projet de thèse de Justine Tavernier portant sur la consolidation bactérienne de pierres calcaires patrimoniales par des bactéries marines, le stage proposé se situe à l’interface entre microbiologie, enzymologie et science des matériaux. Certaines souches bactériennes sélectionnées présentent la capacité d’induire la précipitation de carbonate de calcium (CaCO3) via des mécanismes enzymatiques spécifiques, notamment associés au métabolisme du CO2. Ce phénomène, connu sous le nom de biocalcification, permet la formation naturelle de dépôts minéraux susceptibles de renforcer la structure des matériaux. L’objectif du projet dans lequel s’inscrit le stage est de développer un procédé de bioconsolidation adapté aux pierres calcaires du patrimoine, afin d’en améliorer la cohésion et la durabilité, tout en préservant leur intégrité et leur aspect d’origine.

Objectifs du stage :

Pour ce faire, il est nécessaire de caractériser les bactéries marines sélectionnées ainsi que leur métabolisme. L’objectif du stage est donc d’identifier et d’analyser les voies métaboliques et enzymatiques impliquées dans les processus de biocalcification chez ces souches marines, afin de mieux comprendre les mécanismes biologiques à l’origine de la précipitation du carbonate de calcium et d’évaluer si le procédé consomme du CO2.

Le/la stagiaire contribuera à :

  • Identifier et quantifier les activités enzymatiques clés impliquées dans la biocalcification (anhydrase carbonique, uréase, enzymes impliquées dans le métabolisme du carbone dans ce cas particulier).
  • Étudier la cinétique enzymatique des réactions associées à la précipitation de CaCO3.
    Mettre en œuvre des tests d’inhibition enzymatique pour déterminer le rôle des enzymes dans la formation du minéral dans la pierre calcaire.
  • Explorer la présence de gènes codant les enzymes ciblées.
    Participer aux expérimentations de biocalcification sur pierres pour relier l’activité enzymatique aux dépôts minéraux observés.

Profil recherché :

  • Étudiant(e) de Master 2 en microbiologie, biochimie ou biotechnologies.
  • Connaissances souhaitées en enzymologie et biologie moléculaire (dosage enzymatique, cinétique, PCR).
  • Intérêt pour les processus microbiens naturels et la valorisation du patrimoine cuturel.

Compétences développées

  • Maîtrise des outils d’analyse enzymatique et moléculaire.
  • Approche interdisciplinaire (microbiologie / matériaux / patrimoine).
  • Participation à un projet de recherche appliqué

 

Lieu : Laboratoire LIENSs – UMR 7266 CNRS – La Rochelle Université

Durée : 6 mois

Candidature : envoyer par mail CV, lettre de motivation, relevés de notes (L3, M1), recommandations.

Contacts : Sophie Sablé – sophie.sable@univ-Ir.fr / Justine Tavernier – justine.tavernier@univ-Ir.fr