Vous rejoindrez l’unité Mycologie et Sécurité des Aliments (MycSA) du centre INRAE Nouvelle Aquitaine Bordeaux. MycSA met en œuvre une approche intégrative associant microbiologie, biochimie et biologie moléculaire, pour comprendre les événements qui conduisent à la contamination des céréales et produits dérivés par des métabolites fongiques toxiques, les mycotoxines. Le modèle central d’étude ce sont les champignons phytopathogènes du genre Fusarium du fait de leur fréquente occurrence en Europe et des toxicités avérées des mycotoxines produites.

Vous développerez vos programmes de recherche en interagissant avec tous les membres de notre unité et bénéficierez d’un accès aux plateformes de l’écosystème scientifique bordelais (Plateforme Génome Transcriptome de Bordeaux, Bordeaux Imaging Center, etc.), d’un réseau diversifié de collaborations scientifiques nationales et internationales ainsi que des partenariats socioéconomiques. Nos travaux ont mis en évidence des évènements et mécanismes moléculaires clefs impliqués dans la régulation de la toxinogénèse. Elles ont été obtenues par des approches considérant l’ensemble des cellules constituant un mycélium, sans prendre en compte son hétérogénéité cellulaire résultant de la formation de micro-environnements et d’évènements de différenciation spatio-temporelle.

Outre l’avantage adaptatif apporté par l’existence de populations de cellules dans des états physiologiques distincts, l’existence de cellules fongiques étant capables, au moins dans un laps de temps spécifique, de produire des mycotoxines, soulève l’hypothèse d’un niveau de régulation du métabolisme secondaire médié par une diversification des cellules productrices.

Vous étudierez cette hétérogénéité cellulaire pour comprendre les mécanismes conduisant à la production de mycotoxines ainsi que son importance dans l’adaptation des champignons filamenteux à leur environnement. Vous développerez et appliquerez des approches quantitatives en « cellule unique » et analyserez des variations du transcriptome et du métabolome dans des cellules isogéniques. Votre première tâche sera de décrire cette hétérogénéité au sein d’un tissu mycélien complexe. Cela vous permettra d’apporter un nouveau niveau de connaissance des mécanismes de production de mycotoxines et de leur régulation. Vous aurez ainsi l’opportunité de vous positionner rapidement et de façon pérenne sur un front de science stratégique.