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WP1 - Cartographier la résistance aux antimicrobiens en Nouvelle-Aquitaine

Objectif : Identifier les zones à risque et cartographier la circulation des agents pathogènes résistants dans les écosystèmes humains, animaux et environnementaux.

Leaders :

  • Sophie Alain (RESINFIT, Limoges)
  • Christophe Dagot (RESINFIT, Limoges)

Ce volet se concentre sur :

  • La surveillance des résistances dans les hôpitaux, les élevages et les cultures agricoles.
  • L’analyse des résistances dans les eaux usées, les rivières et les sols.
  • L’identification des points critiques dans la transmission des pathogènes résistants.
  • La création d’une cartographie interactive des résistances en Nouvelle-Aquitaine, intégrant des données environnementales et sanitaires.

Task : 

  • Task 1.1 – Surveillance des résistances aux antiviraux au sein de cohortes de patients : étude des résistances dans la Famille des HERPESVIRUS.
  • Task 1.2 – Surveillance des résistances aux antimicrobiens (antifongiques et antibiotiques) dans l’environnement.
    • 1.2.1 – Cartographie de moisissures du genre Aspergillus et chimiorésistance en Nouvelle Aquitaine.
    • 1.2.2 Surveillance des résistances aux antimicrobiens et des sélecteurs dans l’environnement.

WP2 - Comprendre les mécanismes d’émergence de pathogènes et de résistance

Objectif : analyser les mécanismes d’acquisition, de transfert et de régulation des résistances aux antimicrobiens.

Leaders :

  • Véronique Blanquet (GEIST, Limoges)
  • Julien Buyck (PHAR2, Poitiers)

Les travaux incluent :

  • L’étude des interactions entre les agents pathogènes humains, animaux et environnementaux.
  • La modélisation des mécanismes génétiques responsables de la résistance, notamment les transferts horizontaux de gènes.
  • L’identification des facteurs environnementaux qui favorisent l’acquisition des résistances.
  • L’étude de la dynamique des résistances dans différents écosystèmes (hospitaliers, agricoles et naturels).
 

Task : 

  • Task 2.1 – Rôle de la génétique de l’hôte dans la résistance à la tuberculose bovine.
  • Task 2.2 – Approche One Health de l’étude des modes d’acquisition et de transmission de la résistance aux antibiotiques via les ICE et intégrons, dans deux modèles bactériens ; rôle des pressions de sélection.
    • 2.2.1 – Caractérisation moléculaire et pharmacologique des résistances chez des souches de bacilles à Gram négatif et Mycoplasma spp. environnementales, animales et humaines.
    • 2.2.2 – Fonctionnalité et régulation des ICEs et des IRs dans deux modèles expérimentaux complémentaires, BGN et mycoplasmes.
    • 2.2.3 – Modélisation de la prédiction de la résistance et de sa dissémination par des approches d’Intelligence Artificielle (IA), incluant une perspective philosophique.

WP3 - Innover pour combattre la résistance aux antimicrobiens

Objectif : Innover dans la lutte contre la résistance grâce à des solutions concrètes.

Leaders :

  • Sophie SABLE (LIENSs, La Rochelle)
  • Majid KHATIB (CBMN, Bordeaux)
  • Romain CHEVROT (LIENSs, La Rochelle)
  • Mathieu METIFIOT (MFP, Bordeaux)

Les travaux incluent :

  • Le développement de diagnostics rapides pour détecter les agents pathogènes résistants.
  • La recherche de nouvelles molécules antimicrobiennes ou d’alternatives thérapeutiques non conventionnelles.
  • Le test et la validation d’outils innovants dans des environnements réels (hôpitaux, exploitations agricoles).

Task :

  • Task 3.1 – Innovations pour prévenir et diagnostiquer les résistances aux antimicrobiens chez des bactéries critiques.
    • 3.1.1 Développement/amélioration de techniques de diagnostic culturales rapides.
    • 3.1.2 Diagnostique génétique de l’antibiorésistance bactérienne chez Helicobacter pylori.
  • Task 3.2 – Innovations pour le développement d’alternatives aux traitements actuels.
    • 3.2.1 Optimisation des traitements actuels.
    • 3.2.2 Utilisation des bioressources locales/régionales pour l’obtention de nouveaux composés antimicrobiens d’origine naturelle (plantes, champignons, bactéries marines).
    • 3.2.3 Identification de cibles innovantes.
    • 3.2.4 Envergure nationale et transfert socio-économique.

WP4 - Développer des outils d’information et de formation adaptés à différents publics

Objectif : Sensibiliser et former divers publics aux enjeux de la résistance aux antimicrobiens.

Leaders :

  • Catherine Dumartin (BPH, Bordeaux)

 

Les travaux incluent :

  • La conception de programmes de sensibilisation adaptés aux écoliers et étudiants.
  • La vulgarisation scientifique pour le grand public via des conférences, des ateliers et des supports numériques.
  • L’organisation de campagnes de sensibilisation régionales sur l’utilisation responsable des antimicrobiens.
  • La formation continue pour les professionnels de santé et les décideurs politiques.
 

Tasks : 

  • Task 4.1 – Construire et déployer des outils pédagogiques One Health adaptés aux actions de service sanitaire des étudiants en santé et aux différents publics scolaires.
  • Task 4.2 –  Dissémination grand public.
  • Task 4.3 – Former les différents acteurs aux problématiques de la résistance aux antimicrobiens et du One Health, en lien avec le DU « Antibiorésistance et Approche globale One Health« .